Если используется WM Marco (не компиз), то причиной исчезновения рамок окна может быть результат включенного инструмента Maximus Window Management.
Этот инструмент был введен в Ubuntu 14.04. По мнению разработчиков он позволяет более рационально использовать пространство рабочего стола на экранах с маленьким разрешением.
Чтобы он не работал, его можно отключить/удалить из запускаемых приложений